梭菌在成人的粪便中

梭状芽孢杆菌属厌氧细菌属，其中一些属于胃肠道正常微生物群的一部分，即女性生殖道。另外，有时这些微生物存在于皮肤表面和口腔中，但它们居住的主要地方是肠。

在成人健康人的粪便中，梭菌的含量不得超过105cfu / g。粪便对梭菌的细菌学检查可用于临床症状的患者，如：

粪便对梭菌的细菌学研究是在排泄物分析粪便菌群的过程中进行的，其允许确定哪些微生物和以何种量存在于人肠中。结果的可靠性很大程度上取决于研究材料收集的正确性。

梭菌的危害

大多数梭菌属物种不是致病性的并参与蛋白质的加工。结果，释放有毒物质吲哚和分散物，其以少量刺激肠蠕动并促进粪便通过。但随着胃肠道梭状杆菌数量的增加，这些有毒物质的量增加，这可能导致发生诸如腐败性消化不良等病状。

某些类型的梭状芽孢杆菌是危险的，会导致可导致死亡的严重疾病：

随着肉毒中毒和破伤风，神经系统和肌肉组织受到影响。气性坏疽是伤口过程的一种并发症，其中身体由于受影响的分解产物而迅速中毒组织。

产气荚膜梭状芽孢杆菌（Clostridia perfringens）是气体坏疽的致病因子，当食用受感染的食物时也会导致身体中毒。梭状芽孢杆菌产生毒素，这是中毒发生的主要因素。

可导致这些微生物的另一种疾病是与抗生素相关的腹泻。这种疾病是由于服用抗生素而产生的，这些抗生素不仅抑制致病性，而且抑制正常的肠道微生物群落。结果，梭菌（以及其他致病菌）的数量增加。